许泉课题组成立于2026年，依托上海交通大学系统生物医学教育部重点实验室、系统生物医学国家级国际联合研究中心等国家级科研平台，致力于利用计算生物学、人工智能与类器官技术，系统研究正常发育与重大疾病发生发展的分子机制及基因表达调控网络。课题组围绕单细胞组学、多组学整合、机器学习、基因调控网络解析以及类器官模型构建等前沿方向开展研究，拥有完善的高性能计算资源、多组学分析平台和多种人源类器官培养体系，为基础研究和精准医学转化提供先进的技术支撑。课题组秉承开放、合作、创新的科研理念，致力于培养具有国际竞争力的青年科研人才。诚挚欢迎生命科学、生物医学、计算生物学、人工智能等相关领域的优秀青年加入课题组，共同探索生命科学前沿，推动精准医学发展。
课题组长： 许泉
邮箱：xuquan@sjtu.edu.cn
课题组成员：
博士后：颜溪
博士生：王浩，于艳红
硕士生：单馨
主要研究方向:
1，正常与疾病类器官模型构建及应用；
2，单细胞与空间多组学数据整合及疾病调控网络解析；
3，生物信息学算法与人工智能计算方法开发。
课题组网站：https://bioqxu.github.io
微信公众号：
代表性成果
1. Akkerman, N.*, Xu, Q.*, ..., Camp, JG.#, Beumer, J.# (2026). An organoid model of the human adrenal cortex identifies drivers of steroidogenesis and zonation. Cell Press Blue. Highlighted in Cell Stem Cell.
2. Xu, Q.*,#, Halle, L.*, ..., Treutlein, B.#, Theis, F.#, Camp, JG.# (2025). An integrated transcriptomic cell atlas of human endoderm-derived organoids. Nature Genetics. Highlighted in Nature.
3. Xu, Q.*, Okuda, R.*, Gjeta, B.*, ..., Treutlein B.#, Camp, JG.# (2025). Integrated cell atlas and tumoroids chart pancreatic cancer therapeutic targets. bioRxiv.
4. Xu, Q., ..., Zhou, H.#, van Heeringen, S.J.# (2021). ANANSE: An enhancer network-based computational approach for predicting key transcription factors in cell fate determination. Nucleic Acids Research.
5. Soares, E.*, Xu, Q.*, Li, Q.*, ..., Tang, F.#, Zhou, H.# (2019). Single-cell RNA-seq identifies a reversible epithelial-mesenchymal transition in abnormally specified epithelia of p63 EEC syndrome. PNAS.
6. Guo, Y.*, Xu, Q.*, ..., Maniatis, T.#, Wu, Q.# (2015). CRISPR Inversion of CTCF Sites Alters Genome Topology and Enhancer/Promoter Function. Cell. Highlighted in Cell and Nature Reviews Molecular Cell Biology.
